Pengenalpastian dan pencirian gen trichoderma virens UKM1 mengekod enzim terlibat dalam pencuraian kitin krustasea

Kitin merupakan polisakarida struktur yang dapat dicurai oleh enzim kitinolisis kepada pelbagai terbitan yang boleh digunakan dalam bidang perubatan, pertanian dan rawatan air. Pengenalpastian dan pencirian gen-gen Trichoderma virens UKM1 mengekod enzim terlibat dalam pencuraian kitin krustasea tela...

Full description

Bibliographic Details
Main Authors:	Abdul Munir Abdul Murad, Rafidah Badrun, Sakina Shahabudin, Shazilah Kamaruddin, Madihah Ahmad Zairun, Farahayu Khairuddin, Nor Muhammad Mahadi, Rosli Md. Illias, Zamri Zainal, Farah Diba Abu Bakar
Format:	Article
Language:	English
Published:	Universiti Kebangsaan Malaysia 2013
Online Access:	http://journalarticle.ukm.my/6274/ http://journalarticle.ukm.my/6274/ http://journalarticle.ukm.my/6274/1/03_Abdul_Munir.pdf

id	ukm-6274
recordtype	eprints
spelling	ukm-62742016-12-14T06:40:42Z http://journalarticle.ukm.my/6274/ Pengenalpastian dan pencirian gen trichoderma virens UKM1 mengekod enzim terlibat dalam pencuraian kitin krustasea Abdul Munir Abdul Murad, Rafidah Badrun, Sakina Shahabudin, Shazilah Kamaruddin, Madihah Ahmad Zairun, Farahayu Khairuddin, Nor Muhammad Mahadi, Rosli Md. Illias, Zamri Zainal, Farah Diba Abu Bakar, Kitin merupakan polisakarida struktur yang dapat dicurai oleh enzim kitinolisis kepada pelbagai terbitan yang boleh digunakan dalam bidang perubatan, pertanian dan rawatan air. Pengenalpastian dan pencirian gen-gen Trichoderma virens UKM1 mengekod enzim terlibat dalam pencuraian kitin krustasea telah dilakukan melalui penjanaan penanda jujukan terekspres (ESTs) dan analisis pengekspresan gen menggunakan mikroatur DNA. Sebanyak tiga perpustakaan cDNA T. virens UKM1 yang masing-masing diaruh oleh kitin, glukosamina dan kitosan telah dibina. Sejumlah 1536 klon cDNA telah dijujuk dan sebanyak 1033 ESTs berkualiti telah dijana. Seterusnya, perbezaan pengekspresan gen apabila pertumbuhan kulat diaruh dengan kehadiran kitin krustasea dan tanpa kitin pada hari ketiga dan kelima telah ditentukan. Sebanyak 1824 klon cDNA telah dititik ke atas slaid kaca dan dihibrid bersama dengan cDNA terlabel Cy3 atau Cy5 yang disintesis daripada mRNA yang dipencil daripada kulat yang ditumbuhkan dalam medium mengandungi kitin krustasea atau glukosa (kawalan). Sebanyak 91 dan 61 gen, masing-masing bagi hari ketiga dan kelima didapati terekspres melebihi dua gandaan apabila kulat menggunakan kitin krustasea sebagai sumber karbon. Beberapa gen mengekod kitinase seperti ech1 dan cht3 (endokitinase), nag1 (eksokitinase) dan nagB (glukosamina 6-P-deaminase) didapati terekspres dengan tinggi pada kedua-dua hari. Selain daripada itu, gen mengekod protein hidrofobin, protease serina dan beberapa protein hipotetik juga terekspres dengan tinggi dengan kehadiran kitin krustasea. Protein-protein ini dijangka memainkan peranan penting dalam membantu pencuraian kitin krustasea. Universiti Kebangsaan Malaysia 2013-06 Article PeerReviewed application/pdf en http://journalarticle.ukm.my/6274/1/03_Abdul_Munir.pdf Abdul Munir Abdul Murad, and Rafidah Badrun, and Sakina Shahabudin, and Shazilah Kamaruddin, and Madihah Ahmad Zairun, and Farahayu Khairuddin, and Nor Muhammad Mahadi, and Rosli Md. Illias, and Zamri Zainal, and Farah Diba Abu Bakar, (2013) Pengenalpastian dan pencirian gen trichoderma virens UKM1 mengekod enzim terlibat dalam pencuraian kitin krustasea. Sains Malaysiana, 42 (6). pp. 715-724. ISSN 0126-6039 http://www.ukm.my/jsm/
repository_type	Digital Repository
institution_category	Local University
institution	Universiti Kebangasaan Malaysia
building	UKM Institutional Repository
collection	Online Access
language	English
description	Kitin merupakan polisakarida struktur yang dapat dicurai oleh enzim kitinolisis kepada pelbagai terbitan yang boleh digunakan dalam bidang perubatan, pertanian dan rawatan air. Pengenalpastian dan pencirian gen-gen Trichoderma virens UKM1 mengekod enzim terlibat dalam pencuraian kitin krustasea telah dilakukan melalui penjanaan penanda jujukan terekspres (ESTs) dan analisis pengekspresan gen menggunakan mikroatur DNA. Sebanyak tiga perpustakaan cDNA T. virens UKM1 yang masing-masing diaruh oleh kitin, glukosamina dan kitosan telah dibina. Sejumlah 1536 klon cDNA telah dijujuk dan sebanyak 1033 ESTs berkualiti telah dijana. Seterusnya, perbezaan pengekspresan gen apabila pertumbuhan kulat diaruh dengan kehadiran kitin krustasea dan tanpa kitin pada hari ketiga dan kelima telah ditentukan. Sebanyak 1824 klon cDNA telah dititik ke atas slaid kaca dan dihibrid bersama dengan cDNA terlabel Cy3 atau Cy5 yang disintesis daripada mRNA yang dipencil daripada kulat yang ditumbuhkan dalam medium mengandungi kitin krustasea atau glukosa (kawalan). Sebanyak 91 dan 61 gen, masing-masing bagi hari ketiga dan kelima didapati terekspres melebihi dua gandaan apabila kulat menggunakan kitin krustasea sebagai sumber karbon. Beberapa gen mengekod kitinase seperti ech1 dan cht3 (endokitinase), nag1 (eksokitinase) dan nagB (glukosamina 6-P-deaminase) didapati terekspres dengan tinggi pada kedua-dua hari. Selain daripada itu, gen mengekod protein hidrofobin, protease serina dan beberapa protein hipotetik juga terekspres dengan tinggi dengan kehadiran kitin krustasea. Protein-protein ini dijangka memainkan peranan penting dalam membantu pencuraian kitin krustasea.
format	Article
author	Abdul Munir Abdul Murad, Rafidah Badrun, Sakina Shahabudin, Shazilah Kamaruddin, Madihah Ahmad Zairun, Farahayu Khairuddin, Nor Muhammad Mahadi, Rosli Md. Illias, Zamri Zainal, Farah Diba Abu Bakar,
spellingShingle	Abdul Munir Abdul Murad, Rafidah Badrun, Sakina Shahabudin, Shazilah Kamaruddin, Madihah Ahmad Zairun, Farahayu Khairuddin, Nor Muhammad Mahadi, Rosli Md. Illias, Zamri Zainal, Farah Diba Abu Bakar, Pengenalpastian dan pencirian gen trichoderma virens UKM1 mengekod enzim terlibat dalam pencuraian kitin krustasea
author_facet	Abdul Munir Abdul Murad, Rafidah Badrun, Sakina Shahabudin, Shazilah Kamaruddin, Madihah Ahmad Zairun, Farahayu Khairuddin, Nor Muhammad Mahadi, Rosli Md. Illias, Zamri Zainal, Farah Diba Abu Bakar,
author_sort	Abdul Munir Abdul Murad,
title	Pengenalpastian dan pencirian gen trichoderma virens UKM1 mengekod enzim terlibat dalam pencuraian kitin krustasea
title_short	Pengenalpastian dan pencirian gen trichoderma virens UKM1 mengekod enzim terlibat dalam pencuraian kitin krustasea
title_full	Pengenalpastian dan pencirian gen trichoderma virens UKM1 mengekod enzim terlibat dalam pencuraian kitin krustasea
title_fullStr	Pengenalpastian dan pencirian gen trichoderma virens UKM1 mengekod enzim terlibat dalam pencuraian kitin krustasea
title_full_unstemmed	Pengenalpastian dan pencirian gen trichoderma virens UKM1 mengekod enzim terlibat dalam pencuraian kitin krustasea
title_sort	pengenalpastian dan pencirian gen trichoderma virens ukm1 mengekod enzim terlibat dalam pencuraian kitin krustasea
publisher	Universiti Kebangsaan Malaysia
publishDate	2013
url	http://journalarticle.ukm.my/6274/ http://journalarticle.ukm.my/6274/ http://journalarticle.ukm.my/6274/1/03_Abdul_Munir.pdf
first_indexed	2023-09-18T19:46:26Z
last_indexed	2023-09-18T19:46:26Z
_version_	1777405931236098048

Pengenalpastian dan pencirian gen trichoderma virens UKM1 mengekod enzim terlibat dalam pencuraian kitin krustasea

Similar Items